O Museu começou a desenvolver-se a partir de 1986 com o objectivo de proteger, valorizar e dar a conhecer os tesouros artísticos da Igreja Matriz de Santi Prosdocimo e Donato e de outras Igrejas da zona.
As obras conservadas no Museu são de diferentes naturezas: pintura, escultura, artes aplicadas; todos fundamentais para seu valor artístico ou histórico. Em primeiro lugar, a grandiosa “Ceia de Emaús”, obra-prima datada de 1537 de Jacopo Bassano, e a “Lamentação sobre o Cristo Morto”, atribuída a Andrea da Murano, do final do século XV. Na entrada, para receber os visitantes, encontra-se uma antiga estátua de Sant’Antonio Abate, datada de 1300 a 1400, que revela a quem foi dedicado o primeiro edifício sagrado da cidade amuralhada. A seguir estão pinturas, estátuas, objetos sagrados e vestimentas litúrgicas que nos contam a história e a fé de uma comunidade.
